Enzymy

 0    78 flashcards    PiotrHaduch
download mp3 print play test yourself
 
Question język polski Answer język polski
Jak nazywają się niebiałkowe enzymy
start learning
rybozymy
Apoenzym
start learning
nieaktywne białko enzymatyczne bez koenzymu/kofaktora
Holoenzym
start learning
Aktywne białko enzymatyczne zawierające koenzym/kofaktor
Miejsce/centrum aktywne
start learning
Trójwymiarowe zagłębienie, zawierające łańcuchy boczne aminokwasów uczestniczących w w wiązaniu substratu i katalizie, łącząc go niekowalencyjnie w kompleks enzym-substrat. Posiada miejsce wiązania i miejsce katalityczne
Grupy boczne aminokwasów, biorących udział w wiązaniu substatu w centrum aktywnym enzymu
start learning
beta-karboksylowe asparaginianu, gamma-karboksylowe glutaminianu, eta-aminowe lizyny, azot w pierścieniu imidazolowym histydyny, grupy OH seryny, treoniny, tyroksyny i SH cysteiny
Wpływ enzymu na energię aktywacji i swobodną
start learning
obniża energię aktywacji i nie wpływa na energię swobodną
Jak oblicza się stałą Michaelisa i czego jest miarą?
start learning
Stężenie substratu, przy którym prędkość reakcji jest równa połowie prędkości maksymalnej. Jest miarą powinowactwa wobec danego substratu
Klasy enzymów
start learning
oksydoreduktazy, transferzay, hydrolazy, liazy, izomerazy i ligazy
oksydoreduktazy
start learning
enzymy katalizujące reakcje utleniania i redukcji
Transferazy
start learning
Enzymy katalizujące przenoszenie reszt glikozylowych, grup metylowych i fosforanowych.np. aminotransferaza alaninowa
Hydrolazy
start learning
Enzymy katalizujące hydrolityczne rozszczepienie niektórych wiązań przy udziale WODY.np. arginaza, ureaza, proteazy
Liazy
start learning
Enzymy katalizujące rozszczepienie niektórych wiązań, eliminację atomu z wytworzeniem lub usunięciem wiązania podwójnego np. fumaraza
Izomerazy
start learning
Enzymy katalizujące geometryczne lub strukturalne zmiany w obrębie cząsteczki np. izomeraza fosfotriozowa
Ligazy
start learning
Enzymy katalizujące wiązanie się dwóch cząsteczek, hydrolizując jednocześnie ATP.np. syntetaza glutaminowa
grupa prostetyczna
start learning
Niebiałkowy składnik enzymu, niezbędny do jego aktywności katalitycznej stale związany z częścią białkową
Czym różnią się enzymy aktywowane przez metal od metaloprotein
start learning
dla metaloprotein jon metalu jest grupą prostetyczną, a dla enzymów aktywowanych przez metal kofaktorem
Izoenzymy
start learning
Fizycznie różne formy enzymu katalizującego tą samą reakcję, o delikatnych różnicach we właściwościach. Stosunki ilościowe konkretnych izomerów mogą wskazywać na toczący się proces chorobowy w organizmie, a zwłaszcza zawału serca
Wpływ temperatury na szybkość reakcji
start learning
Zazwyczaj wzrasta w przedziale 0-40 stopni, przy czym na każde podniesienie sie temperatury o 10 stopni, szybkosc wzrasta dwukrotnie
Wpływ aktywatora allosterycznego na pracę enzymu
start learning
Prędkość maksymalna jest osiągana przy mniejszym stężeniu substratu - stała Michaelisa maleje
Wpływ inhibitora allosterycznego na pracę enzymu
start learning
Prędkość maksymalna jest osiągana przy większym stężeniu substratu - stała Michaelisa rośnie
Katal
start learning
Aktywność enzymu przekształcającego 1 mol substratu w 1 sekundę w 30 stopniach i optymalnym pH
Międzynarodowa jednostka enzymatyczna (unit)
start learning
Aktywność enzymu przekształcającego 1 mikromol substratu w czasie 1 minuty w temperaturze 30 stopni, w optymalnym ph
Inhibicja kompetecyjna
start learning
Inhibitor jest podobny do substratu i konkuruje o miejsce aktywne enzymu z nim. Powoduje zmniejszenie powinowactwa enzymu do substratu, zwiększenie stałej Michaelisa. Wpływ inhibitora jest odwracany przez zwiększenie stężenia substratu
Inhibicja niekompetecyjna
start learning
Inhibitor nie jest podobny do substratu, wiąże się z enzymem poza miejscem aktywnym i nie konkuruje z substratem. OBNIŻA PRĘDKOŚĆ MAKKSYMALNĄ REAKCJI, stała Michaelisa bez zmian
Modyfikacja kowalencyjna białek
start learning
Fosforylacja i defosforylacja (przyłączanie reszt fosforanowych do grup OH seryny, treoniny i tyrozyny) przez kinazy białkowe w obecności ATP. W wyniku procesu białka cechują się mniejszą lub większą aktywnością
Regulacja allosteryczna
start learning
Przyłączanie się cząsteczki efektora (aktywatora/inhibitora allosterycznego) do miejsca poza centrum aktywnym, najczęściej w podjednostce regulacyjnej
Rola koenzymów
start learning
Przenoszenie grup funkcyjnych, atomów wodoru lub elektronów. Współdziałają głównie z
Znane koenzymy
start learning
NAD+, NADP+, FMN, FAD, Koenzym A, SAM, Biotyna, Liponian, Pirofosforan tiaminy, fosforan pirydoksalu, tetrahydrobiopteryna, tetrahydrofolian, hem, ATP, UTP, GTP, CTP, Koenzym B12
Nazwa i funkcja NAD+
start learning
Pochodna wit. B3, Dinukleotyd nikotynamidoadeninowy; Transportuje protony i elektrony od dehydrogenaz do łańcucha oddechowego
Nazwa i funkcja NADP+
start learning
Pochodna wit. B3, Fosforan dinukleotydu nikotynamidoadeninowego; Transportuje protony i elektrony od dehydrogenaz do syntezy kwasów tłuszczowych i cholesterolu
nazwa i funkcja FMN
start learning
Pochodna wit. B2, flawinomononukleotyd; ściśle związany z białkiem enzymatycznym jak grupa prostetyczna niektórych oksydaz. JEst jednym z przenośników protonów i elektronów w łańcuchu oddechowym
nazwa i funkcja FAD
start learning
Pochodna wit. B2, dinukleotyd flawinoadeninowy; Trwale związany z białkiem enzymatycznym, Bezpośredni akceptor atomów wodoru od niektórych substratów
Koenzym A
start learning
PRzenośnik grup acylowych poprzez wiązanie tioestrowe (powstałe przez reakcję SH), do którego są przyłączone reszty kwasowe
S-Adezynometionina (SAM)
start learning
PRzenośnik grupy metylowej
Biotyna
start learning
Wiąże i przenosi CO2 jako karboksybiotyna, a CO2 jest uwalniane do reakcji karboksylacji
Liponian
start learning
Przejściowy akceptor grup acylowych w procesie oksydacyjnej dekarboksylacji alfa-ketokwasów
Diagnostyka zawału serca po aktywności izoenzymów
start learning
LDH-1 zaczyna przewyższać LDH-2 w osoczu krwi, dodatkowo po 1-2 dniach po zawale gwałtownie wzrasta aktywność CK-2
Jak małe zmiany pH wpłyną na konformację enzymów i ich aktywność
start learning
Zmniejszenie aktywności przez zaburzenia w oddziaływaniach wodorowych i jonowych
Jak duże zmiany pH wpłyną na konformację enzymów i ich aktywność
start learning
denaturacja - brak aktywności katalitycznej
Wpływ stężenia enzymu na szybkość reakcji
start learning
Szybkość reakcji jest wprost proporcjonalna do stężenia enzymu
Wpływ stężenia substratu na szybkość reakcji
start learning
Szybkość rośnie wprost proporcjonalnie do osiągnięcia optimum, w którym enzymy są wysycone substratem. Dalsze zwiększanie stężenia nie zmienia szybkości reakcji
przykład inhibitora kompetecyjnego w cyklu Krebsa
start learning
Malonian - inhibitor dehydrogenazy bursztynianowej
2 przykłady inhibitora niekompetecyjnego nieodwracalnego
start learning
cyjanki są inhibiotrem oksydazy cytochromowej; kwas acetylosalicylowy dla cyklooksygenazy typu 1
Inhibicja akompetecyjna
start learning
Inhibitor łączy się tylko z kompleksem E-S w miejscu innym niż allosteryczne i aktywne. Jest nieodwracalny, także przez zwiększenie stężenia substratu. Km zmniejsza się (powinowactwo pozornie zwiększa) i Vmax zmniejsza się
Inhibicja samobójcza
start learning
Nieodwracalne przyłączenie inhibitora podobnego do substratu do miejsca aktywnego, w wyniku czego inhibitor jest modyfikowany i wiąże się trwale z enzymem
Co katalizuje fosforylację, a co defosforylację
start learning
fosforylacja - kinazy; defosforylacja - fosfatazy
Reakcja katalizowana przez katalazę
start learning
2H2O2 -> 2H2O + O2
Reakcja katalizowana przez peroksydazę
start learning
AH2 + H2O2 -> A + H2O
karboksypeptydaza A
start learning
enzym proteolityczny ze związanym jonem Zn2+, który odłącza od białka/peptydu pojedyncze aminokwasy C-końcowe oprócz lizyny i argininy. Szczególnie aktywny wobec aminokwasów c-końcowych z pierścieniem aromatycznym lub długim alifatycznym łańcuchem bocznym
reakcja katalizowana przez cyklazę adenylanową
start learning
ATP -> 3'-5' cAMP + PPi
jony metali będącymi kofaktorami
start learning
Ca2+, Mg2+, Zn2+, Fe2+, Fe3+, K+, Na+, Mn2+, Cu+, Cu2+
specyficzność substratowa enzymu
start learning
Rodzaj substratu ulegającego przemianie i określanie powinowactwa enzymu do substratu. Odpowiada za nią apoenzym
Specyficznosć działania/kierunkowa enzymu
start learning
określa typ katalizowanego procesu. Odpowiada za nią kofaktor
Enzymy NIE...
start learning
... wpływają na energię swobodną, nie zmieniają poziomu energetycznego substratów i produktów, nie wpływają na równowagę reakcji, nie zużywają się podczas reakcji
Funkcja i z czego składa się CoA?
start learning
Przenoszenie grup acylowych, witamina B5 (kwas pantotenowy), cysteamina i ADP
Jaka inhibicja?
start learning
Kompetecyjna
Jaka inhibicja?
start learning
Kompetecyjna
Jaka inhibicja?
start learning
Niekompetecyjna
Jaka inhibicja?
start learning
akompetecyjna
Jaka inhibicja?
start learning
niekompetecyjna
Jaka inhibicja?
start learning
akompetecyjna
Na jakie podklasy dzielą się oksydoreduktazy?
start learning
dehydrogenazy, oksydazy, oksygenazy, reduktazy, peroksydazy
Dehydrogenazy
start learning
Utleniają substrat przez przeniesienie jednego lub więcej protonów na akceptor NAD+/FAD.np. dehydrogenaza alkoholowa, dehydrogenaza jabłczanowa
Reduktazy
start learning
Redukują substrat przez uwodornienie go. Jako źródło elektronów i protonów używają NADPH.np. Reduktaza dihydrofolianowa
Peroksydazy
start learning
Redukują H2O2 i organiczne nadtlenki utleniając np. glutation (peroksydaza glutationowa), H2O2 (katalaza zarazem utlenia i redukuje H2O2 do H2O i O2)
Oksydazy
start learning
Przenoszą protony i elektrony na tlen z wytworzeniem wody.np. oksydaza cytochromowa
Oksygenazy
start learning
Przyłączają tlen do substratu; monooksygenazy/hydroksylazy wprowadzają 1 atom tlenu z wytworzeniem grupy OH i wody, dioksygenazy przyłączają 2 atomy wodoru najczęściej w miejsce wiązania podwójnego
stężenie aktywności enzymatycznej
start learning
liczba katali/U na 1 dm3 roztworu
Aktywność właściwa enzymu
start learning
liczba katali/U na jednostkę masy białka enzymatycznego
Aktywność molowa enzymu
start learning
liczba katali/U na 1 mol białka enzymatycznego
Regulacja procesów enzymatycznych - aktywacja lub dezaktywacja
start learning
Ograniczona proteoliza, modyfikacja kowalencyjna, sprzężenie zwrotne, sprzężenie następcze (feedforward), enzymy allosteryczne
aminokwasy katalityczne
start learning
aminokwasy z naładowanymi/polarnymi łańcuchami bocznymi. Biorą bezpośredni udział w wiązaniu substratu
aminokwasy niekatalityczne
start learning
aminokwasy z niepolarnymi łańcuchami bocznymi. Biorą pośredni udział w wiązaniu substratu - zapewniają środowisko hydrofobowe, wspomagają tworzenie miejsca aktywnego, mogą przytrzymywać substrat blisko niego
Pirofosforan tiaminy
start learning
Pochodna witaminy B1 będąca kofaktorem oksydacyjnej dekarboksylacji a-ketokwasów (dla pirogronianu nazywa się reakcją pomostową)
Fosforan pirydoksalu
start learning
Pochodna witaminy B6 zwanej pirodoksyną. Jest przenośnikiem grup aminowych w transaminacji i bierze udział w dekarboksylacji aminokwasów
liponian
start learning
Kofaktor oksydacyjnej dekarboksylacji alfa-ketokwasów (dla pirogronianu to reakcja pomostowa) - jest przejściowym akceptorem grupy acylowej; Może neutralizować wolne rodniki grupami SH, przenosząc na nie wodór.
Biotyna
start learning
Witamina H/B7 przenosi CO2 jako karboksybiotyna - jest kofaktorem karboksylaz biotynozależnych
Reakcja katalizowana przez dysmutazę ponadtlenkową
start learning
2O2- +2H+ -> H2O2 + O2

You must sign in to write a comment