kwasy nukleinowe

 0    80 flashcards    PiotrHaduch
download mp3 print play test yourself
 
Question język polski Answer język polski
temperatura topnienia DNA
start learning
Moment, w którym cz. DNA traci swoją strukturę spiralną
Funkcja Polimerazy DNA III u Prokariontów
start learning
syntezuje potomne DNA
Funkcja polimerazy DNA I u Prokariontów
start learning
usuwa startery i uzupełnia braki między fragmentami Okazaki
Jaką funkcję ma topoizomeraza w replikacji DNA?
start learning
znosi napięcia torsyjne i rozplata podwójną helisę DNA
Jaki enzym zrywa wiązania wodorowe między niciami DNA podczas replikacji?
start learning
helikaza
Jakie wiązanie znajduje się między zasadą azotową, a deoksyrybozą w DNA?
start learning
N-beta-glikozydowe
Jakie wiązanie znajduje się między resztą fosforanową, a deoksyrybozą w DNA?
start learning
estrowe
Jak nazywa się wiązanie łączące grupę 3' hydroksylową i 5' sąsiedniego nukleotydu?
start learning
fosfodiestrowe
Jak nazywa się wiązanie między grupami fosforanowymi w trójfosforanach nukleozydów?
start learning
bezwodnikowe
zasady purynowe
start learning
adenina, guanina i ich metabolity: ksantyna i hipoksantyna
zasady pirymidynowe
start learning
cytozyna, tymina, uracyl
czym jest tautomeryzacja zasad azotowych?
start learning
Odwracalne przemieszczanie atomów wodoru w obrębie cząsteczki. postać laktimowa przekształca się w postać laktamową i na odwrót. w pH=7 dominuje postać laktamowa, więc najczęściej ona jest przedstawiana we wzorach
inozyna
start learning
nukleozyd zawierający hipoksantynę(puryna)
ksantozyna
start learning
nukleozyd zawierający ksantynę(puryna)
czym jest nukleozyd?
start learning
zasada azotowa połączona z pentozą
z czego wynika zdolność kwasów nukleinowych do absorbowania światła 260 nm (efekt hiperchromowy)
start learning
aromatyczne pierścienie puryn i pirymidyn
Histon H1 cechy charakterystyczne
start learning
Najbardziej zmienny gatunkowo, a nawet tkankowo. Największy najbardziej zasadowy, bardzo bogaty w lizynę, bierze udział w regulacji ekspresji genetycznej, zbliża do siebie kolejne nukleosomy
z czego składa się nukleosom?
start learning
oktamer histonowy, 1 3/4 obronu DNA z 146 par zasad
Jak oddzielić histony od DNA?
start learning
traktowanie chromatyny roztworem soli lub rozcieńczonym kwasem
Z czego składa się chromatosom?
start learning
oktamer histonowy, 2 obrony DNA z 166 parami zasad, histon H1
kolejność upakowania DNA
start learning
podwójna helisa, nukleosomy z DNA łącznikowym, solenoid-nić 30nm, pętle i domeny chromatyny, chromosom
Jak nazywają się białka zapobiegające asocjacji jednonicowego DNA podczas replikacji?
start learning
białka wiążące jednonicowe DNA (SSB)
Topoizomeraza 1, a 2
start learning
topoizomeraza 1: nacina pojedyńczą nić, nie wymaga ATP Topoizomeraza 2 nacina obydwie nici, wymaga ATP, jest bardzo efektywna w usuwaniu sueprskrętów
Polimeraza alfa - funkcja
start learning
aktywność primazy, wydłużanie starterów
polimeraza gamma - funkcja
start learning
replikacja mitochondrialnego DNA
polimeraza beta - funkcja
start learning
naprawa DNA, uzupełnianie luk
polimeraza delta - funkcja
start learning
wydłużanie fragmentów Okazaki na nici opóźnionej, aktywność egzonukleazy 3'->5' (korekta)
polimeraza epsilon - funkcja
start learning
synteza DNA na nici wiodącej, aktywność egzonukleazy 3'->5' (korekta), kontroluje cykl komórkowy, zwiększa wydajność procesu polimeryzacji
Telomeraza
start learning
Odwrotna transkryptaza, umożliwiająca uzupełnienie ubytku po usunięciu startera na terenie telomeru. Wykazuje aktywność w komórkach zarodkowych, macierzystych i nowotworach
Nić kodująca - inna nazwa, kierunek, transkrypt RNA będzie identyczny do niej czy komplementarny?
start learning
nić sensowna, 5'->3', transkrypt jest identyczny (oprócz różnicy między uracylem a tyminą)
Nić matrycowa - inna nazwa, kierunek, transkrypt RNA będzie identyczny do niej czy komplementarny?
start learning
nić antysensowna, 3'->5', transkrypt jest komplementarny do niej
Co znajduje się na nici matrycowej i kodującej?
start learning
Na matrycowej geny, a na kodującej sekwencje promotorowe, regulatorowe i sygnały STOP
Polimeraza RNA I + czy jest hamowana przez amanitynę
start learning
syntezuje większość rRNA w jąderku, niewrażliwa na amanitynę
Polimeraza RNA II + czy jest hamowana przez amanitynę
start learning
syntezuje pre-mRNA, snRNA, snoRNA, miRNA w nukleoplazmie, jest bardzo wrażliwa na amanitynę
Polimeraza RNA III + czy jest hamowana przez amanitynę
start learning
syntezuje tRNA i 5S rRNA w nukleoplazmie, jest wrażliwa na amanitynę, ale tylko w wysokich stężeniach
Najważniejsze miejsce promotorowe do syntezy RNA
start learning
kaseta TATA w miejscu -25
Heterochromatyna
start learning
Stanowi około 10% chromosomu interfazowego, jej histony są silnie zmetylowane
Modyfikacja kowalencyjna histonów
start learning
Acetylacja lizyny, zwiększa aktywność transkrypcyjną, metylacja argininy i lizyny zmniejsza aktywność transkrypcyjną, a także fosforylacja
Najważniejszy, pierwszy czynnik transkrypcyjny
start learning
białko TBP (TATA binding protein) wchodzące w skłąd TFIID
obróbka pre-mRNA
start learning
spicing, dodanie 5'czapeczki i 3'poliadenylacja
Jak zachodzi tworzenie 5' czapeczki mRNA?
start learning
Na końcu 5' znajdują się trzy grupy fosforanowe. Jedna jest hydrolizowana, łączy się z GTP z odłączeniem pirofosforanu. Azot N7 guaniny ulega acetylacji.
Rola 5' czapeczki w mRNA
start learning
stabilizują cząsteczkę mRNA chroniąc koniec 5' przed nukleazami i ułatwia oddziaływanie z rybosomem
Rola ogona 3' poli (A)
start learning
Stabilizuje mRNA, chroni jego koniec przed nukleazami, zwiększa wydajność translacji. Jest powoli skracany w cytosolu
Funkcja snRNA, snoRNA
start learning
Są to rybozymy wchodzące w skład spliceosomu
modyfikacja potranskrypcyjna tRNA
start learning
odłączenie UU z końca 3' i zastąpienie go CCA, wycięcie 14 nukleotydowego intronu, modyfikacja zasad azotowych
Co jest najbardziej energochłonnym procesem w komórkach
start learning
synteza białek (ok 90% energii)
co jest potrzebne do translacji?
start learning
mRNA, tRNA, aminokwasy, syntazy aminoacylo tRNA, ATP, GTP, rybosom, czynniki inicjujące, elongacyjne i terminujące
kodony terminacyjne / STOP
start learning
UAA, UAG, UGA
Co zachodzi po kolei w inicjacji translacji
start learning
mała podjednostka łączy się z mRNA przy jego końcu 5' z udziałem IF-3, a następnie w obecności IF-1, IF-2, GTP przyłącza aminoacylo-tRNA W MIEJSCU P(wyjątek). Następnie przyłącza się duża jednostka, a IF-y się odłączają
Co jest źródłem energii dla translokacji rybosomu podczas elongacji
start learning
GTP
Czym jest transferaza peptydylowa
start learning
rybozym wchodzący w skład większej jednostki rybosomu, który katalizuje powstanie wiązania peptydowego między aminokwasami wykorzystując energię hydrolizy wiązania aminokwasu z tRNA
terminacja translacji
start learning
jeżeli w miejscu A rybosomu znajdzie się kodon stop (UAA, UAG, UGA), to w obecności czynników uwalniających RF1+RF3 lub RF2+RF3 następuje oderwanie łańcucha polipeptydowego od tRNA i dysocjacja rybosomu
Pierwsza modyfikacja posttranslacyjna u Prokaryota
start learning
deformylacja metioniny
Hydroksylacja proliny i lizyny
start learning
Hydroksylazy prolilowe i lizylowe w obecności Fe2+, witaminy C, alfa-ketoglutaranu i tlenu cząsteczkowego katalizują tą reakcję. alfa-ketoglutaran jest dekarboksylowany do bursztynianu
modyfikacje posttranslacyjne
start learning
usunięcie grupy formylowej z metioniny(prokariota), fosforylacja, metylacja, usunięcie sekwencji sygnałowych, karboksylacja, tworzenie mostków disiarczkowych, glikozylacja, izoprenylacja, dodanie grup prostetycznych, ograniczona proteoliza
Translokacja (import) białek do mitochondrium zachodzi przez jakie kompleksy translokacyjne?
start learning
Błona zewnętrzna: TOM, wewnętrzna: TIM
Rybosom eukariotyczny - stała sedymentacji i podjednostki
start learning
80S; mała podjednostka - 40S (18S rRNA), duża podjednostka 60S (5S, 5,8S, 28S rRNA)
Charakterystyka wiązania w aminoacylo-tRNA
start learning
grupa karboksylowa wiąże się wiązaniem estrowym z grupą OH rybozy 3' lub 2'
Rodzajów tRNA jest więcej, tyle samo czy mniej niż aminokwasów
start learning
więcej
enzymy restrykcyjne
start learning
specyficzne endonukleazy hydrolizujące wiązania fosfodiestrowe w obu łańcuchach DNA
Co to
start learning
Cytozyna
Co to
start learning
Tymina
Co to
start learning
Uracyl
Co to
start learning
Adenina
Co to
start learning
Guanina
streptomycyna
start learning
wiąże się z podjednostką 30S rybosomu prokariotycznego
tetracykliny
start learning
wiąże się z podjednostką 30S rybosomu, hamując wiązanie aminoacylo-tRNA
chloramfenikol
start learning
wiąże się z 50S podjednostką prokariotycznego i hamuje transferazę peptydylową
erytromycyna
start learning
wiąże się z 50S podjednostką prokariotycznego, hamuje translokacje
puromycyna
start learning
Łączy się z miejscem A rybosomu - analog aminoacylo-tRNA
Cykloheksimid
start learning
Wiąże się z podjednostką 60S kom. eukariotycznych i hamuje transferazę peptydylową
aktynomycyna D
start learning
wiąże się z DNA, który nie może być matrycą mRNA - hamuje transkrypcję
zmodyfikoweane zasady azotowe w tRNA
start learning
ok 10% ulega modyfikacji: pseudourydyna, dihydrourydyna
Działanie toksyny błoniczej
start learning
Hamuje translokazę u Eucaryota (enzym przesuwający peptydylo-tRNA - miejsca A do P)
Co decyduje o przemieszczeniu peptydu do ER i jakie są tego cechy charakterystyczne?
start learning
Peptyd sygnałowy o dlugosci 13-26 am. na końcu N. W środku sekwencji kilka-kilkanaście aminokwasow hydrofobowych i maja przynajmniej jeden aminokwas zasadowy. Odcinane przez peptydazę sygnałową
O-glikozylacja białek
start learning
Grupa OH seryny i treoniny łączy N-acetyloglukozoaminę, a ta ewentualnie kolejne cukry
N-glikozylacja białek
start learning
Wiązanie cukru przez grupe aminowa boczna asparaginy. Pośredniczy w jej fosforan dolicholu
marker kierujący białka z aparatu Golgiego do lizosomu (glownie jego enzymy)
start learning
mannozo-6-fosforan
Białko opiekuńcze odpowiadające za fałdowanie glikoprotein w ER
start learning
kalneksyna
Modyfikacje białek kierujące je do błon
start learning
mirystylacja konca N, palmitylacja reszt cysteiny, farnezylacja i geranylogeranylacja końca C

You must sign in to write a comment